Acțiunea din Soul Eater se desfășoară la Academia Meșterilor Armelor Morții, situată în orașul fictiv Death City din Nevada, Statele Unite. Școala este condusă de Shinigami, cunoscut și sub numele de Moartea, ca o unitate de antrenament pentru oamenii cu abilitatea de a se transforma în arme, precum și pentru mânuitorii acelor arme, numiți meșteri. La această școală învață meșterul Maka Albarn și partenerul ei coasă, Soul Eater; asasinul Black Star și partenera sa Tsubaki Nakatsukasa, care se poate transforma în arme precum o kusarigama, un shuriken și un ninjatō; și fiul lui Shinigami, Death the Kid, împreună cu partenerii săi pistoale, Liz și Patty Thompson.